戰斗中負傷而下身癱瘓的前海軍戰士杰克薩利決定替死去的同胞哥哥來到潘多拉星操縱格蕾絲博士用人類基因與當地納美部族基因結合創造出的 “阿凡達” 混血生物。

杰克的目的是打入納美部落，外交說服他們自愿離開世代居住的家園，從而SecFor公司可砍伐殆盡該地區的原始森林，開采地下昂貴的“不可得”礦。

在探索潘多拉星的過程中，杰克遇到了納美部落的公主娜蒂瑞，向她學習了納美人的生存技能與對待自然的態度。

與此同時，SecFor公司的經理和軍方代表上校邁爾斯逐漸喪失耐心，決定訴諸武力驅趕納美人。