一只叫Minkey的黑猩猩和他的搭擋Mike Muggins是偵探社最杰出的偵探。

對這兩個間諜搭擋來說，一切任務都能夠完成。

但在一次任務中，任務完成得不是很順利。

Mike決定退出偵探行業，專心照顧他的女兒Amelia。

Minkey因受關節炎影響，也開始重新尋找他的新生活了，他加入了馬戲團并很快成了大明星。 　　

十年過去了，Mike現在是個保險經記人，他和他12歲的女兒住在一起，女兒平時特別喜歡做些發明創造（她革命性地改進了常規的鉆孔機），并獲得了國家科學成就獎。

給Amelia頒獎的是她最崇拜的人Farley博士，Farley博士同時還邀請她參加他在日本的科學研討會。

Farley正秘密地完善Amelia的鉆孔機，以挖掘出藏在地球核心的世界上最強大的能源。

但同時它也會造成強大的地震把整個日本摧毀。

Mike和Minkey必須進行最后一次合作完成有史以來最艱巨的任務。

挽救 Amelia!